İmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması

Basit Öğe Kaydı
dc.authorid0000-0001-9496-3032
dc.contributor.authorCoşkun, Ayşenur
dc.contributor.authorGökahmetoğlu, Selma
dc.contributor.authorÇevik, Şerife
dc.contributor.authorKarakükcü, Musa
dc.contributor.authorKaynar, Leylagül
dc.contributor.authorMidilli, Kenan
dc.contributor.authorKuşkucu, Mert Ahmet
dc.contributor.authorÖzmen, Pelin
dc.date.accessioned2020-10-26T06:27:30Z
dc.date.available2020-10-26T06:27:30Z
dc.date.issued2020en_US
dc.departmentKapadokya Üniversitesi, Diş Hekimliği Fakültesi, Diş Hekimliği Bölümü
dc.descriptionTARAMAWOS
dc.descriptionTARAMATRDİZİN
dc.descriptionTARAMAPUBMED
dc.descriptionTARAMASCOPUS
dc.description.abstractSitomegalovirüs (CMV), sağlıklı bireylerde asemptomatik seyreden ancak transplantasyon hastaları ve kazanılmış immün yetmezlik sendromlu (AIDS) hasta gruplarında ciddi mortalite ve morbiditeye sebep olan bir virüstür. Gansiklovir (GCV), CMV’ye bağlı enfeksiyonlarda morbidite ve mortaliteyi belirgin bir şekilde azaltan ve tedavide ilk tercih olarak kullanılan bir nükleozit analoğudur. GCV, insanda CMV hastalığının tedavisinde etkinliği gösterilmiş ilk ilaç olup, aynı zamanda asiklovirle homologtur. CMV hastalığını önlemek veya tedavi etmek için uzun süreli antiviral tedavi gereklidir, ancak bu durum direnç gelişimini beraberinde getirmektedir. CMV’de görülen antiviral direnç oranı %8-14 olarak bildirilmektedir. CMV izolatlarında GCV direnci en sık olarak UL97 kinaz gen bölgesinde görülmektedir. Bu çalışmada, immün yetmezliği olan hastalardan elde edilen CMV izolatlarında GCV direncinin araştırılması amaçlanmıştır. Hematoloji servisinde takip edilen 20 çocuk, 29 erişkin toplam 49 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. CMV DNA viral yükü ? 103 kopya/ml olan 49 hastadan elde edilen 53 örnek GCV direnci yönünden incelenmiştir. Çalışmada UL97 gen bölgesinin, 674 baz çifti (bp) büyüklüğündeki kısmında 3500 Abi Prism Genetik Analiz cihazı (Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific, ABD) kullanılarak yapılan Sanger dizi analizi yöntemiyle DNA dizileri belirlenmiştir. Bu yöntemle değerlendirilemeyen örneklere yeni nesil dizileme (NGS) yöntemi uygulanmıştır. Sanger yöntemi ile 53 örneğin 35 (%66)’inde GCV direnci saptanmamıştır. Üç hastada ise C592G, C607S ve M460I GCV direnç mutasyonu tespit edilmiştir. Diziler karışık olduğundan, 15 örnekte Sanger ile direnç değerlendirilememiş ve NGS ile çalışılan bu örneklerde direnç saptanmamıştır. Toplam 49 hastanın 3 (%6.1)’ünde antiviral direnç mutasyonu saptanmıştır. Çalışmaya dahil edilen 20 hastada, literatürde bildirilen ve fenotipik testlerle ilaçlara duyarlı olduğu belirlenen üç varyant sekans (A442G, C592F, A427V) ile literatürde bildirilmeyen 78 varyant sekans saptanmıştır. Sonuç olarak, antiviral direnç saptanması hastaların takibinde önemli olup, tedavinin planlanmasında klinisyeni yönlendirmektedir. Sanger yöntemi ile değerlendirilemeyen örneklerin NGS ile çalışılması gerektiği ve ilk defa saptanan varyant sekansların ilaç direncindeki rolünün belirlenmesi için daha ileri çalışmalara ihtiyaç olduğu sonucuna varılmıştır
dc.identifier.citationCoşkun A, Gökahmetoğlu S, Özmen P, Çevik Ş, Karakükçü M, Kaynar L ve ark. İmmün yetmezlikli hastalardan elde edilen sitomegalovirüs izolatlarındaki gansiklovir direncinin araştırılması. Mikrobiyol Bul 2020;54(4):619-628.
dc.identifier.doi10.5578/mb.70062
dc.identifier.endpage628en_US
dc.identifier.issue4en_US
dc.identifier.scopusqualityN/A
dc.identifier.startpage619en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12695/842
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5578/mb.70062
dc.identifier.volume54en_US
dc.identifier.wosWOS:000582397200010
dc.identifier.wosqualityQ4
dc.indekslendigikaynakWeb of Sceince
dc.indekslendigikaynakScopus
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.indekslendigikaynakPubMed
dc.institutionauthorÖzmen, Pelin
dc.language.isotr
dc.publisherAnkara Mikrobiyoloji Derneği
dc.relation.ispartofMikrobiyoloji Bülteni
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal - Editör Denetimli Dergi
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectAntiviral direnç
dc.subjectgansiklovir
dc.subjectSitomegalovirüs
dc.subjectdizi analizi
dc.subjectmutasyon
dc.titleİmmün Yetmezlikli Hastalardan Elde Edilen Sitomegalovirüs İzolatlarındaki Gansiklovir Direncinin Araştırılması
dc.typeArticle

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
sci-yayın cmv.pdf
Boyut:
521.85 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale / Article
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
[ X ]
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Diş Hekimliği - Makale Koleksiyonu