Hepatit C Virüs (Hcv) Genotiplerinin ”Reverse Hybridisation Strip Assay” ve Dna Dizi Analizi Yöntemleriyle Araştırılması
Yükleniyor...
Tarih
2019
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
KLİMUD
Erişim Hakkı
Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International
info:eu-repo/semantics/openAccess
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Amaç: Kronik HCV hastalarında tedavi öncesi dönemde yapılan genotip tayini, tedavinin süresi ve kalıcılığında önemli bir belirteçtir. Bu çalışmada "Reverse Hybridisation Stripe Assay" ile saptanan genotip ve subtiplerin, dizi analizi yöntemiyle karşılaştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Erciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Viroloji laboratuvarına gelen hastalardan, HCV RNA düzeyleri 104 IU/ml ve yukarı olan kronik HCV 'li 153 hasta çalışmaya dahil edildi. HCV genotip tayini viroloji laboratuvarında ters hibridizasyon temeline dayanan ticari HCV-TS test kiti (LIPA,NLM analytica, İtalya) ile yapıldı. Hastaların HCV genotipleri dizi analizi yöntemiyle ABI Prism 3500 GA cihazında Erciyes Üniversitesi GENKÖK Merkezinde araştırıldı. HCV'nin NS5B gen bölgesinde 340 bp'lik kısım, "nested PCR" yöntemi ile çoğaltıldıktan sonra elde edilen PCR ürünlerinin dizi analizi işlemi gerçekleştirildi. Bulgular: LIPA yöntemiyle çalışılan 153 hastanın %44'ünde Gn 1b ve %20,3'ünde Gn1a saptanırken daha düşük oranlarda Gn2, Gn 2b, Gn 2a/c, Gn 3, Gn 3a, Gn4, Gn 4a, Gn 4c/d, Gn 4h ve Gn5 görülmüş olup, aynı hastaların dizi analizi yöntemiyle %57,5'inde Gn1b, %12,4'ü Gn 4d ve %7,8'i Gn 1a olarak bulunmuştur.
Açıklama
Anahtar Kelimeler
HCV, genotip, LIPA, Dizi analizi
Kaynak
V.ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
Sayı
Künye
ÖZMEN, P. (2019). HEPATİT C VİRÜS HCV GENOTİPLERİNİN REVERSE HYBRİDİSATİON STRİP ASSAY VE DNA DİZİ ANALİZİ YÖNTEMLERİYLE ARAŞTIRILMASI. Presented at the 5. ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ
